Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm9972E9Q053 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms