Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ddx60E9PZQ1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ddx60E9PZQ1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms