Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Brd1E9PZ26 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Brd1E9PZ26 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms