Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc8E9PWG2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms