Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssxb8B1AY40 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ssxb8B1AY40 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ssxb8B1AY40 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssxb8B1AY40 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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