Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Tmem238A9JSM3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Tmem238A9JSM3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms