Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Col9a3A2ACT7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms