Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Speer3W4VSP1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Speer3W4VSP1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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