Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slfn1Q9Z0I7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn1Q9Z0I7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms