Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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Col4a4Q9QZR9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Col4a4Q9QZR9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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