Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ush1cQ9ES64 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms