Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slx4ipQ9D7Y9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slx4ipQ9D7Y9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slx4ipQ9D7Y9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slx4ipQ9D7Y9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slx4ipQ9D7Y9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slx4ipQ9D7Y9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms