Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chmp4cQ9D7F7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp4cQ9D7F7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms