Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Erich6bQ9D4S6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Erich6bQ9D4S6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms