Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Mrpl28Q9D1B9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Mrpl28Q9D1B9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms