Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Utp23Q9CX11 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Utp23Q9CX11 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms