Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rprd1bQ9CSU0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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