Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ncbp2Q9CQ49 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms