Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim3Q99PE5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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