Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Tdrd1Q99MV1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tdrd1Q99MV1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms