Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SrrtQ99MR6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SrrtQ99MR6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms