Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atl3Q91YH5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms