Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp4Q8VHC5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms