Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Impg1Q8R1W8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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