Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Phf13Q8K2W6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Phf13Q8K2W6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Phf13Q8K2W6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Phf13Q8K2W6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Phf13Q8K2W6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms