Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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