Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ercc8Q8CFD5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ercc8Q8CFD5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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