Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc187Q8C5V8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc187Q8C5V8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms