Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Pggt1bQ8BUY9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pggt1bQ8BUY9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms