Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms