Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ube2q1Q7TSS2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms