Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Prrc2bQ7TPM1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prrc2bQ7TPM1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms