Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms