Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sv2cQ69ZS6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sv2cQ69ZS6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms