Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Atg9aQ68FE2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms