Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gja3Q64448 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gja3Q64448 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms