Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ift52Q62559 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms