Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim25Q61510 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim25Q61510 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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