Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3UPC7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3UPC7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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