Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Itgb8Q0VBD0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Itgb8Q0VBD0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms