Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cnn1Q08091 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn1Q08091 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms