Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Siah1bQ06985 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms