Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Prrx2Q06348 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms