Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cacna1sQ02789 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms