Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HmgcrQ01237 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms