Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabpaQ00422 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms