Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pax8Q00288 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms