Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Irx1P81068 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Irx1P81068 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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