Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CgnP59242 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CgnP59242 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CgnP59242 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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