Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cldn18P56857 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms